如今生物保鮮已成為國內外科研工作者研究的重點，利用微生物拮抗菌進行保鮮。菌種保藏方法有傳代保藏法、液體石蠟覆蓋保藏、冷凍干燥保藏、液氮超低溫保藏、蒸餾水保藏等菌種保藏方法,他們各有各的優點，具體使用哪個方法，要針對不同的拮抗菌的特點及保藏目的需要，從而選擇最好的保藏方法。
氣相液氮罐
舉例說明：
液氮超低溫保藏法：是菌種長期保藏的最有效最可靠的方法。液超低溫保藏法是把菌種裝在含有冷凍保護劑的安瓶瓶內，將該安瓶瓶放人液氮（-196℃）中保藏。由于菌絲體處于-196℃，其代謝降低到完全停止的狀態。甘油、血清蛋白、二甲基亞砜、聚乙烯氮戊環、糊精、吐溫80等可用做液氮低溫保藏法的保護劑，其中甘油在進入和游出細胞時速度非常緩慢，造成強烈的脫水，是目前最常用的保護劑。不同微生物要選擇不同的保護劑，再通過實驗加以確定保護劑的濃度，一般甘油為10％-20％、二甲基亞砜為5％-10％、聚乙烯氮戊環為0.4mmol/L。
冷凍干燥保藏法：為菌種保藏方法中最有效的方法之一。這種方法適用于菌種長期保存，一般可保存數年至十余年。因為冷凍干燥法使菌種處于一個無氧的真空環境中，微生物不能進行正常的新陳代謝，只能處于休眠狀態。當環境變為適合生長的適合，才會繼續增殖生長。所以保藏期就比較長。目前像春雷霉素、頭孢霉素、卡那霉素等抗生素菌種不易產生孢子的絲狀真菌，都是采用冷凍干燥法保存的。另外我國大多數生物制品菌種都是采用該法保藏。
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