降溫程序是決定冷凍效果的另一個關鍵因素。若降溫速度過快，細胞內部易形成冰晶對細胞造成損傷;若降溫速度過慢，會因細胞外部介質的水分結冰而導致細胞過度脫水死亡。因為-60~0℃的低溫對細胞的損傷**，因此要選擇合適的降溫程序，讓細胞在能夠適應溫度驟變的前提下，迅速安全地通過這個溫度危險區，提高冷凍效果。根據研究的數據和相關報道，在精子超低溫冷凍前先于4℃平衡15~25min，再于距離液氮面15cm處停留5min，在距離液氮面5cm處停留10min，可使櫛江珧、近江牡蠣、馬氏珠母貝等精子冷凍效果達到**。樣品體積對冷凍效果也有影響。樣品體積的不同可能影響了熱的交換，體積小的樣品降溫快，體積大的樣品降溫慢，這間接造成了降溫條件的差異，導致精子活率不一樣。關于雙殼類最適冷凍體積的探討，朱豪磊認為香港牡蠣在冷凍體積為0.75mL時復蘇效率最高;李純認為紫貽貝、櫛孔扇貝和菲律賓蛤仔的最適精子冷凍體積分別為0.4、1和1mL。有研究的數據顯示，櫛江珧和近江牡蠣精子在冷凍體積為1.0~1.4mL的范圍內保存效率最高。分析以上研究結果不同的原因，一方面是物種間的差異，更重要的是降溫程序存在差異。柯亞夫等認為，不同體積的樣品保存時要對應不同的降溫方法，以達到最適保存效果。所以，1.0~1.4mL的樣品體積最適合櫛江珧和近江牡蠣的研究結果，雙殼類精子的超低溫冷凍保存起始于20世紀70年代。
自增壓液氮罐
雙殼類精子相對于絕大多數脊椎動物而言，體積小、細胞膜薄、細胞內水分少，這些特點非常有利于精子的超低溫冷凍保存。研究的數據顯示近江牡蠣低溫冷凍后精子活率略高于櫛江珧，這暗示著近江牡蠣精子較櫛江珧精子的抗低溫能力較強，可能更適合于精子冷凍保存工作的開展。與此相比，卵子的冷凍保藏技術相對滯后，卵子中存在的大量水分，在冷凍時易形成胞內冰晶而破壞細胞;卵內構成紡錘絲的微管對生化試劑非常敏感;超低溫冷凍易造成透明帶硬化或破裂，而形成多精受精，這些都是亟待解決的技術難題。精子和卵子超低溫保存技術相輔相成，方可有效地推動種質優化和資源保護。
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